公司本部设有综合部、财务部、人力资源部、工程管理部、投资发展部、安全环保部、企业管理部7个部室。
公司下设山东晟华管业科技有限公司、日照海川锦汇商业保理有限公司、日照交通发展再生资源有限公司(控股)、日照莲盛矿业有限公司(控股)、日照交发园工程管理有限公司(控股)、日照莲兴工程管理有限公司(控股)、日照传化交通公路港物流有限公司(参股)、日通新材料科技有限公司(参股)、日照岚山疏港铁路有限公司(参股)、山东铁路投资控股集团有限公司(参股)、鲁南高速铁路有限公司(参股)、日照交通发展投资运营有限公司工程分公司、日照交通发展投资运营有限公司山海天旅游度假区分公司。